Οι Άγιοι Απόστολοι Πέτρος και Παύλος είναι οι πολιούχοι του Γαΐου, και αυτή είναι η εκκλησία τους. Ανήκει στις οικογένειες Τράνακα και Γούλιου και υπάρχει στον κατάλογο του 1686.
Το τέμπλο και οι δεσποτικές εικόνες αγιογραφήθηκαν το 1714 από δύο Γιαννιώτες, τον Αντώνη Νομικό και τον Νικόλαο Χωραφά, με τιμή δεκατέσσερα ριάλια. Ανάμεσα στις παλιές ελαιογραφίες του εικονοστασίου ξεχωρίζει ένας Χριστός πάνω στο πέπλο της Βερονίκης που τον κρατούν άγγελοι, από τις καλύτερες ζωγραφιές του νησιού κατά τον 19ο αιώνα. Μέσα υπάρχει επίσης στασίδι αναγεννησιακού τύπου και ο τάφος της οικογένειας Καφήρη.
Η εκκλησία ανακαινίστηκε το 1858, και το ωραίο καμπαναριό, με δικέφαλο αετό στην κορυφή, φέρει τη χρονολογία 28 Ιουνίου 1860. Στέκει δίπλα στο κοιμητήριο του Γαΐου.
Η παράδοση τοποθετεί εδώ τον τάφο του Γαΐου και του Κρίσπου, των μαθητών που λέγεται ότι έφεραν τον χριστιανισμό στο νησί. Κατ’ άλλη παλιά παράδοση ήταν ο ίδιος ο Απόστολος Παύλος που αποβιβάστηκε στους Παξούς και έδιωξε από εκεί κάθε φαρμακερό ερπετό. Οι ντόπιοι έπαιρναν χώμα από την εκκλησία επί τρεις μέρες ως φυλαχτό ενάντια στα φίδια.
Γιορτή: 29 και 30 Ιουνίου, η μεγαλύτερη μέρα της χρονιάς στον Γάιο.
Πρόσβαση: στον Γάιο, ακριβώς πίσω από τη στάση του λεωφορείου.